請問PCR產(chǎn)物直接測序和克隆后再測序有什么區(qū)別,用PCR產(chǎn)物直接測序不是更省時間嗎,省得再連到載體上了啊

2023-05-14 21:59

3個回答
模板會影響測序
PCR產(chǎn)物直接測序,引物端約有幾十個堿基是測不出來的,如果你恰好關(guān)注這個位置,那么或者從另一端測通(你的產(chǎn)物不長),或者克隆測序
此外,很多時候由于PCR產(chǎn)物不專一,直接測序效果不好,而克隆測序沒這個問題,測序效果好于PCR產(chǎn)物測序。不過,如果你使用普通taq酶,PCR過程中會引入錯誤,用產(chǎn)物直接測序會掩蓋這些錯誤,但克隆測序時則會保留這些錯誤。
PCR直接測序會存在或多或少的套峰,所以通常都采用雙向引物測序,通過堿基互補(bǔ)原則來彌補(bǔ)單向沒測出來的地方??寺『鬁y序就非常準(zhǔn)確了,而且有時候PCR跑出來有雜帶的話就必須克隆后再拿去測序了。我也涉入分子不久,希望回答能幫到你。
相關(guān)問答
克隆測序和PCR產(chǎn)物直接測序有哪些不一樣
1個回答2022-10-01 19:32
眾所周知PCR壙增程現(xiàn)錯配現(xiàn)象能所錯配都發(fā)同位置PCR片段直接測序其結(jié)PCR片段眾混合物結(jié)某點現(xiàn)幾十錯配現(xiàn)象數(shù) (或許幾十萬)點應(yīng)該確測序錯配現(xiàn)象反映 PCR片段直接測序結(jié)反映PCR用模板原始結(jié)PCR...
全文
為什么對PCR產(chǎn)物直接測序沒有測序信號
1個回答2023-02-23 14:40
原因在于測序時經(jīng)歷了PCR反應(yīng)及測序反應(yīng)(測序反應(yīng)本身也是PCR反應(yīng))二次聚合酶的打滑現(xiàn)象.原因不明的復(fù)雜結(jié)構(gòu),測序結(jié)果就出現(xiàn)突然信號減弱或消失.出現(xiàn)這些現(xiàn)象的原因由DNA模板本身立體結(jié)構(gòu)所造成的. ...
全文
DNA測序為什么要克隆到載體上去 而不直接測呢
1個回答2022-06-21 13:00
一個是純化和擴(kuò)大培養(yǎng),一個就是為了獲得想要的dna片段,弄清序列
為什么基因測序前將基因PCR克隆后還要放到大腸桿菌載體上再測序?
4個回答2022-07-12 09:06
補(bǔ)充一個更重要和實際的考慮:實際測序中,可靠的測序結(jié)果往往是從引物后二三十個堿基才開始的。如果片段比較長,超過一次測序能力如七八百之外,即使雙向測序也無法獲得引物(排除非特異擴(kuò)增)或緊鄰引物處的序列時...
全文
為什么pcr可以,但是測序沒有結(jié)果
1個回答2023-02-18 20:16
這個情況我也碰到過。當(dāng)時是我一側(cè)引物序列5`端搞錯,但P出來的產(chǎn)物和原來在一個位置,而且亮度也很強(qiáng)!
為什么非要先克隆到中間載體上測序,而不是直接到
1個回答2023-03-23 08:55
為什么非要先克隆到中間載體上測序 可以不同克隆到載體上。 dna測序過程,其實是pcr的過程,你只要有足夠的模板用于pcr反應(yīng)就行,不一定要克隆到載體上。 當(dāng)然,大多數(shù)都是克隆到載體上,因為你需要將待...
全文
為什么基因測序前將基因PCR克隆后還要放到大腸桿菌
1個回答2022-12-05 23:10
大腸桿菌是一種載體,要是因為測序的原因,獲得的全長序列要經(jīng)過測序驗證,而目前的測序技術(shù)有限,在序列的起始端準(zhǔn)確性不高,所以想要獲得準(zhǔn)確的全長序列就需要克隆到載體上。具體可以了解一下測序的原理。
為什么pcr產(chǎn)物可以直接連t載體
1個回答2022-12-16 10:24
普通的taq聚合酶會在PCR反應(yīng)過程中在3’末端加入一個堿基A,線性化平末端T載體的兩端分別又人工加上一個額外的T堿基,從而可與PCR克隆產(chǎn)物的A末端互補(bǔ)配對,提高了PCR產(chǎn)物連接和克隆的效率。
PCR片段測序信號衰減的原因有哪些啊?
3個回答2022-11-10 09:23
片段里有沒有特殊結(jié)構(gòu)啊?
熱門問答